Uso de IA generativa para el diseño de novo del dominio metamórfico de RfaH en su estado autoinhibido

La proteína metamórfica RfaH es un factor de virulencia bacteriano, el cual cuenta con dos dominios: NTD y CTD. El CTD cambia reversible desde un estado de alfa-hélice a un barril beta mediante un proceso metamórfico. Si bien se han estudiado las posibles rutas de plegamiento reversible entre ambos estados, se desconoce si es que existen otras topologías de plegamiento alternativas para el CTD en el estado autoinhibido. En esta línea, el uso de herramientas de IA generativa para diseño de novo de estructuras de proteínas, como RFDiffusion, permiten explorar nuevas estructuras nunca antes vistas en la naturaleza. El propósito de esta investigación es, por lo tanto, verificar si RFDiffusion permite generar nuevas estructuras para el CTD de RfaH en el estado autoinhibido y analizarla diversidad de estructuras generadas mediante métodos de agrupamiento basados en métricas de superposición estructural