| 07-03-2023 |
SimSpread-Ensemble - Development of an ensemble network-based method for drug discovery
SimSpread is a novel computational method to predict protein–ligand interaction that combines network-based inference with chemical similarity, useful for predicting drug targets, virtual screening, and drug repositioning. This project proposal intents to improve several limitations of SimSpread. Hypothesis: The combination of predictions obtained from SimSpread that use different similarity cutoffs into a single score using a machine learning (ML) model will increase predictive performance, eliminate empty predictions and eliminate the need to optimize similarity cutoff parameter, resulting in a more straightfoward and user-friendly model to predict drug-target interactions. Tasks: • Propose an ensemble predictive model. • Implement a hyperparameter optimization. • Compare the predictive performance. Candidates should have good programming skills.
Keywords:
machine learning
bioinformatica
red
red social
aprendizaje maquina
Proteínas
Diseño de fármacos
Prerequisitos:
no tiene.
Tiene un método de evaluación Nota 1-7, con 20 créditos y tiene 1/1 vacantes disponibles |
Mentor(es): Ver en la plataforma |
| 06-07-2022 |
Análisis de la ola migratoria en Chile
Interesados contactar al profesor adjuntando CV y concentración de notas antes de postular mediante email a pdomingr@ing.puc.cl. ----- El objetivo de esta oportunidad de investigación es el análisis y caracterización de la población migrante en Chile. El trabajo estará fuertemente enfocado en el uso de combinado de distintas fuentes de datos (CENSO, CASEN) y otras fuentes administrativas. Se requiere saber usar STATA, R y/o Python y es recomendable haber realizado el curso de econometría aplicada ICS 2563 y/o algún curso de algoritmos predictivos.
Prerequisitos:
no tiene.
Tiene un método de evaluación Nota 1-7, con 10 créditos y tiene 1/4 vacantes disponibles |
Mentor(es): Ver en la plataforma |
| 07-03-2023 |
Keywords:
machine learning
bioinformatica
red
red social
aprendizaje maquina
Proteínas
Diseño de fármacos
Prerequisites:
None.
Evaluation method: Nota 1-7, with 1/1 available vacants |
Mentor(s): Open in the plataform |
| 06-07-2022 |
Prerequisites:
None.
Evaluation method: Nota 1-7, with 1/4 available vacants |
Mentor(s): Open in the plataform |